Deltacron: Varian COVID-19 atau kesalahan lab?
HEalth

Deltacron: Varian COVID-19 atau kesalahan lab?

Penemuan varian COVID-19 baru yang potensial yang dijuluki “Deltacron” selama akhir pekan telah memecah belah para ahli kesehatan, dengan beberapa mengatakan temuan itu lebih mungkin karena kesalahan pemrosesan laboratorium atau kontaminasi sampel.

Deltacron pertama kali dilaporkan oleh Dr. Leondios Kostrikis, seorang profesor ilmu biologi dan kepala laboratorium bioteknologi dan virologi molekuler di Universitas Siprus, yang menamai galur tersebut karena kemiripan tanda genetiknya dengan Omicron dan Delta.

Kostrikis melaporkan 25 kasus mutasi, mencatat pada saat itu terlalu dini untuk mengatakan apakah ada lebih banyak kasus Deltacron atau apa dampak potensialnya. Data itu dikirim ke database internasional GISAID yang melacak perubahan virus pada hari Jumat.

Meskipun ada kemungkinan varian virus corona untuk “menggabungkan kembali” genom mereka untuk membentuk galur baru, dalam hal ini para ahli kesehatan meragukan temuan Kostrikis, alih-alih menyatakan bahwa varian baru lebih mungkin merupakan kesalahan lab.

Pemimpin tim teknis COVID-19 Organisasi Kesehatan Dunia (WHO) dr. Krutika Kuppali tweeted bahwa “tidak ada yang namanya #Deltacron,” mengatakan itu adalah “kemungkinan artifak pengurutan,” yang dia jelaskan berarti kontaminasi laboratorium dari fragmen Omicron dalam spesimen Delta.

Ketika dihubungi untuk memberikan komentar pada hari Senin, juru bicara WHO mengarahkan CTVNews.ca ke tweet yang diposting pada hari Senin oleh Dr. Maria Van Kerkhove, Ahli Epidemiologi Penyakit Menular dan Pimpinan Teknis COVID-19 di organisasi tersebut.

“Melompat terlambat di sini: Jangan gunakan kata-kata seperti deltacron, flurona, atau flurone. Silahkan, ” Tweet Kerkhove menyatakan, menggemakan Kuppali. “Kata-kata ini menyiratkan kombinasi virus/varian & ini tidak terjadi. ‘Deltacron’ kemungkinan kontaminasi selama pengurutan.”

Deltracron saat ini tidak terdaftar di bawah database “Varian Kekhawatiran” atau “Varian Kepentingan” WHO.

Ahli bioetika dan genetika yang berbasis di Montreal di Institut Penelitian Pusat Kesehatan Universitas McGill dan direktur penjangkauan komunitas untuk Jaringan Respon Cepat Varian Coronavirus Fatima Tokhmafshan mengatakan data saat ini tidak mendukung teori varian gabungan.

Membandingkan evolusi virus corona dengan secarik surat, Tokhmafshan mengatakan urutan varian seperti kode batang yang dipindai di setiap pos pemeriksaan yang dilaluinya.

“Anda dapat melacak langkah-langkahnya dan kemudian Anda dapat menggambar peta … karena perubahannya diperkenalkan dalam genomnya dan berpindah dari satu orang ke orang lain,” katanya dalam wawancara telepon dengan CTVNews.ca Senin. “Genom itu semacam dipindai dan kami dapat membuat silsilah keluarga untuk itu, dan berdasarkan silsilah keluarga itu Anda dapat kembali ke masa lalu dan menempatkan mutasi yang telah diperkenalkan dan membangun sejarah kapan kira-kira hal-hal ini muncul.”

Tokhmafshan mengatakan, berdasarkan pohon filogenetik ini (sejenis diagram yang menunjukkan evolusi gen yang berbeda dari nenek moyang yang sama), para ilmuwan dapat menentukan apakah varian baru telah muncul.

“Dalam kasus varian Transformer khusus ini,” katanya dalam referensi lelucon online bahwa Deltacron terdengar seperti penjahat TV, “Hanya mendapatkan urutan yang memberi tahu Anda bahwa itu memiliki mutasi yang keduanya dari Delta dan Omicron tidak. cukup bagi Anda untuk mengatakan ini adalah rekombinasi baru … kemungkinan ini menjadi varian baru sangat rendah.

Ahli biologi molekuler di Scripps Research Translational Institute Eric Topol bahkan lebih tegas dalam bantahannya atas temuan Kostrikis, men-tweet itu “Deltacron menakutkan. Satu hal lagi yang perlu dikhawatirkan.”

Ahli virologi di Imperial College London Tom Peacock juga turun ke Twitter untuk menjelaskan keyakinannya bahwa Deltacron lebih mungkin melakukan kesalahan lab daripada varian baru.

Di sebuah utas, Peacock memposting itu dia percaya Omicron belum beredar cukup lama untuk membuat rekombinan apa pun dan bahwa “urutan deltakron yang dilaporkan oleh beberapa media besar terlihat jelas merupakan kontaminasi – mereka tidak mengelompok pada pohon filogenetik.”

Merak memposting perbandingan pohon filogenetik dari seharusnya Deltracron varian dan varian rekombinan sejati dari varian Alpha dan Delta yang sebelumnya ditemukan di Jepang untuk menunjukkan perbedaan temuan – terutama bahwa dalam varian rekombinan sejati ada kelompok berbeda di pohon yang menunjukkan materi bersamanya.

Merak mengatakan itu kemungkinan besar semua sampel adalah “semua urutan pada urutan yang sama dijalankan di lab yang sama pada hari yang sama yang memiliki masalah kontaminasi,” tapi dia tidak bisa memastikan.

Terlepas dari bantahan dari rekan-rekan dan pakar tentang datanya, Kostrikis telah menggandakan penemuannya, mengatakan kepada Bloomberg dalam sebuah pernyataan email pada hari Minggu bahwa temuannya bukan kesalahan, dan bahwa infeksi Deltacron ditemukan lebih tinggi di antara pasien yang dirawat di rumah sakit karena COVID-19 daripada di antara pasien yang tidak dirawat di rumah sakit, yang katanya mengesampingkan teori kontaminasi laboratorium.

Kostrikis juga mengatakan bahwa sekuensing yang sama ditemukan oleh laboratorium di Israel. Dia tidak memberikan spesifik atau nama lab dalam pernyataannya.

Namun, Tokhmafshan menunjukkan ketika ditanya tentang klaim terbaru Kostrikis bahwa jika sampel yang dia kirim ke lab di Israel adalah sampel yang berpotensi terkontaminasi yang sama dengan yang digunakan di labnya di Siprus, mereka tentu saja akan mendapatkan hasil yang sama.

“Jika sampel asli Anda tidak disiapkan dengan benar, jika Anda memiliki beberapa kontaminasi dan jika saya mengirimkannya ke 10 laboratorium lain, itu adalah sampel yang sama, mereka akan mendapatkan hasil yang sama,” katanya. “Saya ingin tahu ketika mereka mengatakan sebuah laboratorium di Israel mendapatkan hal yang sama, — apakah mereka menemukan orang baru dengan nama yang sama persis? [mutation] di lokasi geografis yang sama sekali berbeda? Jika itu masalahnya, maka saya akan tertarik. ”

CTVNews.ca menghubungi Kostrikis tetapi tidak mendapat tanggapan pada saat publikasi.

“Saya ingin meyakinkan warga Kanada bahwa ada entitas ilmuwan yang sangat berdedikasi, ilmuwan interdisipliner yang tidak dibayar oleh pemerintah, bukan oleh perusahaan mana pun yang melakukan pekerjaan yang sangat, sangat melelahkan ini,” kata Tokhmafshan tentang temuan Deltacron. “Kami memantau evolusi virus dan memantau apa yang terjadi di sini di Kanada dan juga di seluruh dunia… kami memang akan membunyikan alarm jika hal gaya Transformers muncul.”


Posted By : hk hari ini